法科学家发声!溯源不应基于政治偏见的有罪推定
从公然把新冠病毒称为“武汉病毒”,到悍然退出世卫组织,美国一直都试图把疫情政治化、病毒污名化、溯源工具化,甚至全然无视科学和事实,炒作有罪推定的“实验室泄漏论”,肆意鼓吹针对中国开展新一轮溯源调查,严重干扰国际溯源研究合作。
美国及一些西方媒体不择手段散播“政治病毒”,企图误导公众,破坏科学溯源工作,引起科学界公愤。对此,欧洲精准医疗平台首席科学家、巴斯德研究所免疫学博士鞠丽雅在接受科技日报采访时指出,溯源工作必须尊重客观事实,尊重科学数据,摒除政治偏见。
全球标杆竟被扣上源头罪名
鞠丽雅博士表示,武汉病毒研究所于2020年1月12日向联合国世界卫生组织提交了新冠病毒全基因组序列。由于提交的测序结果质量高、描述清晰,该基因序列被“全球共享流感数据倡议组织”(GISAID)等多个数据库用来作为重要的“参照序列”。
鞠丽雅介绍,根据GISAID数据库的描述,“参照序列”是用于和此后继续录入的新冠病毒基因序列做对照比较,用以观察全球各地新冠病毒的基因特点。
之所以能够作为“参照序列”,这得益于中国科学家利用长期以来积累的平台、技术和人才优势,迅速确定新型冠状病毒,并快速和高质量地完成病毒毒株分离和全基因组序列测定。第一时间向全球分享病毒基因序列,不仅成为全球新冠病毒数据库的起始“标杆”,更为各国开展抗病毒药物筛选、病毒检测和疫苗研究提供了基础,也为全球抗击疫情赢得了时间。
但这样的成果却被一些媒体利用,将其作为新冠病毒起源于武汉的所谓证据。如在法国《电报》题为“为什么布列塔尼变异株是20C”的报道中,作者以科普的形式介绍新冠病毒的分类与变异株命名方法,并“专业”地引用GISAID数据库的新冠病毒序列比较分枝图。
但该报道对该科学图表作出的解释是,“武汉发现的19A和19B是新冠疫情初期的主要病株。从19A派生出的20A于2020年3月占领欧洲,继而分布全球。20B和20C是从20A派生出的庞大分枝”。为了表明其专业性,报道还引用一张源于跟踪全球新冠变异株网站Nextstrain的简化示意图,并解释说,“Nextstrain根据GISAID数据库的病毒序列所做的新冠病毒基因特点可视化的工具”。
对于广大读者而言,看到这里都会认为全球流行的新冠病毒都是从武汉发现的19A病毒株变异来的,该报道也就”成功“地将病毒源头锁定在武汉。但实际情况并非如此。
鞠丽雅博士介绍,GISAID数据库于2016年建立,用于监测禽流感病毒序列,在新冠疫情暴发后开始向全球征集新冠病毒序列,以便进行相互之间的比较。通过其网站可以看到这样的图表(下图),显示从疫情初期至今收录的全球新冠病毒序列和模拟的关系图谱。
GISAID数据库对于最初收录的19A有专门说明 (下图):“鉴于 Wuhan/Hu-1/2019 的高质量测序结果,被GISAID用来作为正式参照序列”。
所谓的“参照序列”,用于“被参照序列”进行比较,以鉴别不同新冠病毒的基因差异。具体来说,数据库利用计算机软件处理,主要是基于氨基酸相对突变率矩阵(常用PAM250)计算出不同序列间的差异性积分,而推演出可能的序列演化树。在这里,有一个定义必须弄清楚,用序列间的差异靠计算机软件做出来的“进化树”关系,只是一种理论性的演化推断,而不是家系或传代关系。所以GISAID数据库的图表不是亲子或传代关系。就好像白人与黑人做比较,二者都是人,计算机登记的差别在于肤色,但不是亲子关系。
另一个权威的新冠病毒序列数据库,NIH下属的NCBI新冠病毒资源库也同样非常清楚的标注,参照序列采用的是中国发表的NC_045512/HU-1序列。(下图)
根据GISAID和NCBI的病毒基因库数据还延伸出一系列的病毒分析软件系统,比如Next strain,PangoLineages,CovSpectrum,Mutation Situation Reports,CoVariants等。但无论软件采用什么计算方法,参照序列的原则没有变。“参照”序列不是“源头”序列,这个是最起码的科学常识。
鞠丽雅认为,中国科学家最先发现、测序并向全球分享的新冠病毒基因序列是人类抗击疫情的“首战”,首战告捷。中国发布首个序列让抗击新冠由盲目应对进入到可测定、可诊断、可跟踪的新阶段,该贡献具有里程碑意义。而且迄今全球开发的新冠疫苗都离不开中国报告的基因序列。这一成果早已经成为全球合作抗疫的“标杆”。
但西方媒体不尊重客观事实,竟然将全球数据库引用的参考标杆作为源头的证据,不得不怀疑其专业性和用心。